Prowadzone działania w Jastrzębskiej Spółce Kolejowej doprowadziły do uzyskania w dniu 24.07.1998 r. koncesji wydanej na okres 50 lat (wraz z późniejszymi zmianami - Decyzja Ministra Infrastruktury z dnia 25 listopada 2001 r. w sprawie zmian koncesji) na wykonywanie działalności gospodarczej polegającej na zarządzaniu liniami kolejowymi.
W 2003 r. Ustawa o transporcie kolejowym koncesję zastąpiła świadectwem bezpieczeństwa wydawanym na okres 5 lat. Spółka pierwsze świadectwo bezpieczeństwa Nr 019/ZI/04 otrzymała 01.04.2004 r., które straciło ważność 22 grudnia 2006 r. Kolejne świadectwo Nr 098/ZI/06 wydane zostało 22 grudnia 2006 r.
Od 10.01.2011 roku firma posiada Autoryzację Bezpieczeństwa - Część A - o Nr PL212110001 wydana została na podstawie Decyzji Prezesa UTK Nr TTN-0211-A-06/2010r. z datą ważności od 10.01.2011 roku (zaktualizowana od 19.11.13 - Nr PL21210130000) do 09.01.2016 roku natomiast Część B o Nr PL 2220120001 z datą ważności do 03.04.2016 roku (zaktualizowana od 04.04.14 - Nr PL2220140000).
W dniu 04.01.2016 roku Prezes Urzędu Transportu Kolejowego Decyzją DBK-WSZM.41.5.2015.EE wydał ujednoliconą Autoryzację Bezpieczeństwa nr PL2120150009 z datą ważności od 10.01.2016 roku.
W dniu 27.04.2017 roku Prezes Urzędu Transportu Kolejowego Decyzją DBK-WSZM.410.2.2017.RP wydał ujednoliconą Autoryzację Bezpieczeństwa nr PL2120170000 z datą ważności od 27.04.2017 roku.
Od dnia 27.07.2021 r. obowiązuje Autoryzacja Bezpieczeństwa - PL212021005 wydana przez Prezesa Urzędu Transportu Kolejowego.
Obszar zarządzany obejmuje tory stacyjne kopalń: Borynia, Budryk, Jastrzębie, Szczygłowice, Knurów, Zofiówka i Pniówek wraz z przyległymi torami szlakowymi oraz stację zdawczo-odbiorczą Pawłowice Górnicze. Dodatkowo zarządzany jest obszar bocznicy Knurów Zwałowisko, bocznic własności JSW KOKS S.A. : Radlin, Jadwiga i Dębieńsko oraz bocznicy własności WZK Victoria S.A. w Włabrzychu.
Całkowita długość torów (stacyjnych i szlakowych) pod zarządem Jastrzębskiej Spółki Kolejowej Sp. z o.o. objętych Autoryzacją Bezpieczeństwa wynosi około 224 km.
Ponadto Jastrzębska Spółka Kolejowa Sp. z o.o. posiada Świadectwa Bezpieczeństwa :
- Nr 180/UK/17 dla użytkownika bocznicy Koksowni Przyjaźń w Dąbrowej Górniczej;
JSK Sp. z o.o. jako pełnoprawny Zarząd Kolei prowadzi działalność w zakresie:
- udostępniania infrastruktury kolejowej i świadczeniu usług kolejowych w terminalach towarowych zlokalizowanych na liniach i bocznicach
- utrzymania budowli i urządzeń infrastruktury kolejowej,
- budowy i remontów układów torowych oraz obiektów kolejowych,
- wykonywania usług projektowych i ekspertyz,
- usuwania skutków szkód górniczych,
- prowadzenia działalności szkoleniowej, promocyjnej i innowacyjnej.
Posiadana przez Spółkę Autoryzacja Bezpieczeństwa jest dokumentem stwierdzającym, że spółka spełnia wymogi ustawy o transporcie kolejowym z dnia 28.03.2003 r. ( tekst jednolity Dz.U.2020.1043 z dnia 15 czerwca 2020 r póź. zmianami).
Zarządca Infrastruktury kolejowej ma obowiązek zapewnienia warunków technicznych i organizacyjnych umożliwiających:
- bezpieczne prowadzenie ruchu kolejowego;
- bezpieczną eksploatację pojazdów kolejowych;
- ochronę przeciwpożarową i ochronę środowiska.
Dlatego Jastrzębska Spółka Kolejowa Sp. z o.o. sukcesywnie podnosi jakość infrastruktury kolejowej poprzez wykonywanie remontów, modernizację i inwestycje oraz poprzez właściwe jej bieżące utrzymanie.
Stan posiadanej infrastruktury jest dla Jastrzębska Spółka Kolejowa Sp. z o.o. jednym z najważniejszych mierników jakości świadczonych Przewoźnikom usług, ponieważ od jakości infrastruktury zależy bezpieczeństwo i prawidłowa organizacja prowadzonego ruchu kolejowego.
Spółka prowadzi współpracę w zakresie udostępnienia linii kolejowych z wieloma Przewoźnikami oraz innymi Zarządami Kolei.
W ramach realizacji swojego zakresu usług Spółka:
- prowadzi szkolenia dla pracowników służb kolejowych,
- organizuje egzaminy, kursy, egzaminy kontrolne i specjalistyczne.
Jastrzębska Spółka Kolejowa Sp. z o.o. posiada własną Komisję Egzaminacyjną powołaną przez Urząd Transportu Kolejowego do przeprowadzania specjalistycznych egzaminów kwalifikacyjnych, weryfikacyjnych oraz kontrolnych dla stanowisk związanych bezpośrednio z prowadzeniem ruchu na liniach kolejowych tj. manewrowego, ustawiacza i zwrotniczego.
Od 2002 r. Spółka jest członkiem Izby Gospodarczej Transportu Lądowego.
Od 2004 do 2017 roku Spółka była członkiem Izby Przemysłowo-Handlowej Rybnickiego Okręgu Przemysłowego.
Od 2006 do 2017 roku Spółka była członkiem Forum Kolejowego Railway Bussines Forum.
Od 2013 do 2017 roku była członkiem Polskiej Izby Producentów Urządzeń i Usług na rzecz Kolei.